Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms