Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc146E9Q9F7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc146E9Q9F7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc146E9Q9F7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc146E9Q9F7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc146E9Q9F7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc146E9Q9F7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc146E9Q9F7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc146E9Q9F7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc146E9Q9F7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc146E9Q9F7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms