Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc141E9Q8Q6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc141E9Q8Q6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc141E9Q8Q6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc141E9Q8Q6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc141E9Q8Q6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms