Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Arhgef5E9Q7D5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Arhgef5E9Q7D5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms