Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp31E9Q6Y8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp31E9Q6Y8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms