Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms