Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DspE9Q557 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DspE9Q557 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DspE9Q557 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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