Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CenpfE9Q3P4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CenpfE9Q3P4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CenpfE9Q3P4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CenpfE9Q3P4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CenpfE9Q3P4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CenpfE9Q3P4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CenpfE9Q3P4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CenpfE9Q3P4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms