Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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NebE9Q1W3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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NebE9Q1W3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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NebE9Q1W3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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NebE9Q1W3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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