Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdzd2E9Q1M1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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