Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3893E9Q1I1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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