Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt78E9Q0F0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms