Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms