Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5415E9PXF3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5415E9PXF3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms