Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn4E9PX29 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn4E9PX29 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms