Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rsf1E9PWW9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms