Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim30bE9PVL6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30bE9PVL6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.1 ms