Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms