Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttc17E9PVB5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc17E9PVB5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms