Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt2E9PUL5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt2E9PUL5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt2E9PUL5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt2E9PUL5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt2E9PUL5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt2E9PUL5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt2E9PUL5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt2E9PUL5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt2E9PUL5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms