Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms