Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1110002E22RikE0CYV9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1110002E22RikE0CYV9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms