Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC035044E0CXF8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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BC035044E0CXF8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BC035044E0CXF8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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