Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms