Protein–RNA interactions for Protein: D3Z536

Gm8225, Predicted gene 8225, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8225D3Z536 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8225D3Z536 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8225D3Z536 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8225D3Z536 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8225D3Z536 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8225D3Z536 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8225D3Z536 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8225D3Z536 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8225D3Z536 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8225D3Z536 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8225D3Z536 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8225D3Z536 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8225D3Z536 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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