Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc6D3YZP9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms