Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm4950D3YUM8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm4950D3YUM8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm4950D3YUM8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm4950D3YUM8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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