Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cttnbp2B9EJA2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Cttnbp2B9EJA2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms