Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Phf11bB4XVQ1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Phf11bB4XVQ1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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