Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Phf11cB4XVP9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11cB4XVP9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms