Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr3aB2RXC6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr3aB2RXC6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr3aB2RXC6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr3aB2RXC6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr3aB2RXC6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr3aB2RXC6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Polr3aB2RXC6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3aB2RXC6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms