Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms