Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5483B2RV77 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms