Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm4787B2RUD9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4787B2RUD9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms