Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf3B2KF05 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms