Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms