Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd5B1AYB6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd5B1AYB6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms