Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxa1B1AUS7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxa1B1AUS7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ssxa1B1AUS7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxa1B1AUS7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms