Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms