Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm16430A6X8J1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms