Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SetxA2AKX3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms