Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms