Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd5A2A8L1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd5A2A8L1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd5A2A8L1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd5A2A8L1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chd5A2A8L1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chd5A2A8L1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chd5A2A8L1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chd5A2A8L1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chd5A2A8L1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chd5A2A8L1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chd5A2A8L1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chd5A2A8L1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chd5A2A8L1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chd5A2A8L1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms