Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hivep3A2A884 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hivep3A2A884 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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