Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms