Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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