Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv1A0A0B4J1G7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms