Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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Usp29Q9ES63 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp29Q9ES63 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms