Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Zbed3Q9D0L1 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms