Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
Cldn16Q925N4 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Cldn16Q925N4 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms